药物基因和蛋白筛选国家工程实验室于2008年7月批准建设，实验室建有基因与蛋白表达检测、基因文库与肽库、中药化学成分、筛选模型、基因与蛋白鉴定、中药成分鉴定、药物活性体外检测、动物转基因等研发平台。
以系统生物学、功能基因组学、转录组学、蛋白组学的理论与技术研究为基础，开展以成药基因和成药蛋白筛选为核心的药物筛选工作，主要着眼于以成药基因和成药蛋白作为进一步开展中药有效成分筛选的靶标，利用其建立适合于高通量筛选的药物筛选模型，通过大规模的中药化学成分样品库筛选，发现能够有效增强成药基因表达和提高成药蛋白活性及功能中药有效成分，在此基础上开发组成成分明确，作用机理清楚的现代中药新药。
实验室紧密围绕重大疾病防治的需要，不断提高基因工程和蛋白药物创新领域的自主创新能力，积极完成国家有关部门委托的科研课题，开展相关产业关键技术攻关、重要技术标准研究制定，凝聚、培养产业急需的技术创新人才。
