1996年，南京医科大学以“生殖医学”作为特色方向，通过多学科交叉组合，组建了生殖医学中心。1997年江苏省政府正式批准成立江苏省生殖医学重点实验室，2004年入选成为科技部和江苏省共建的国家重点实验室培育点。在2005、2007和2010年江苏省省级重点实验室检查评估中，本实验室评估成绩优秀，2005年成为江苏省国家重点实验室培育建设点，2008年又成为国家人口和计划生育委员会生殖医学重点实验室，2011年3月生殖医学实验室被科技部批准立项筹建国家重点实验室。
研究方向
一、配子发生的分子机制
研究内容：重点研究人类配子发生过程中遗传信息稳定传递的分子机制。
预期目标：揭示配子发生过程中关键基因／蛋白的功能，为其他三个研究方向提供理论依据。
二、配子发生障碍的病理
研究内容：重点研究我国常见环境因素、遗传因素、环境-基因交互作用以及代谢等疾病对配子发生的影响。
预期目标：阐明不孕不育发病机制，为制定相关环境监测、人群暴露和职业卫生标准提供科学依据。
三、不孕不育诊治与出生缺陷防范
研究内容：重点研发和优化不孕不育诊治的辅助生殖技术；开展出生缺陷的筛查与治疗。
预期目标：应用研发和优化的辅助生殖技术，提高不孕不育诊治水平和降低子代出生缺陷的风险。
四、生殖内分泌激素与相关疾病
研究内容：重点研究雌／雄激素对配子发生、肿瘤生成、以及对组织器官生长、发育、衰老的影响和机制。
预期目标：阐明雌／雄激素分泌紊乱导致靶器官相关疾病发生的分子机制。
