黔东南民族职业技术学院是在整合贵州省黔东南民族农业学校、黔东南苗族侗族自治州卫生学校（国家级重点中专）、黔东南苗族侗族自治州财贸学校、黔东南苗族侗族自治州民族林业学校资源的基础上，于2001年8月经贵州省人民政府批准、教育部备案，2002年5月正式挂牌成立的公办全日制普通高等职业学院。2012年8月学院整体搬迁，结束了分四个校区办学的历史，进入了新的发展时期---开启了向国家级特色院校、西部地区一流高职院校目标迈进的新征程。

——贵州省黔东南民族农业学校创建于1956年3月，开办有农学、牧医、土肥、果树、园艺、植保、生物技术等专业。

——黔东南苗族侗族自治州卫生学校1958年11月创建于历史文化名城镇远。1987年12月，新校址确定在凯里市美丽的金泉湖畔破土动工，1991年3月，部分师生迁往凯里新校区，1995年9月搬迁完毕。2000年8月成为“省部级重点中专”，2001年3月经教育部评估确定为“国家级重点中专学校”，主要开办护理、临床、药学专业。

——黔东南苗族侗族自治州财贸学校创建于1963年，1966年停办，1975年恢复建校，1977年11月省政府批准，由黔东南苗族侗族自治州财贸干部学校更名为黔东南苗族侗族自治州财贸学校，校址设在凯里市洗马河，主要开办财务会计、财务管理、市场营销、会计电算化、计算机应用等专业。

——黔东南苗族侗族自治州民族林业学校于1986年经贵州省人民政府批准筹建，1988年9月建成，同年开始招生。1994年9月，经州人民政府批准，黔东南州森工技校（1980年9月建立）并入黔东南州民族林校，集中两校人、财、物并调整重组，实行“两块牌子、一个班子、一套管理机构”的管理模 式，主要开办林学、林业经济管理等专业。1994年，国家第四十三技能鉴定站在黔东南州民族林校挂牌成立，主要开展林业行业特有工种职业技能鉴定。