鄂尔多斯应用技术学院是在2008年开办的内蒙古大学鄂尔多斯学院的基础之上，于2015年4月整合内蒙古工业大学矿业学院、内蒙古医科大学鄂尔多斯学院等办学资源组建的全日制普通本科院校，是地方高校转型发展过程中教育部批准成立的第一批以“应用技术”命名的本科院校。