新疆第二医学院是一所以医学类为主，理学、管理学等多学科协调发展的自治区直属全日制普通本科高校。学院前身是新疆医科大学厚博学院，创办于2003年，为全日制普通本科独立学院。2012年，经自治区人民政府批准，新疆医科大学与克拉玛依市采取合作办学的方式共同建设厚博学院。2015年9月，厚博学院整体迁至克拉玛依市。2021年1月，国家教育部批准厚博学院转设为新疆第二医学院。