1个教育部和广东省重点实验室（光电子器件与系统重点实验室）；

1个国防科技重点实验室（ATR国防科技重点实验室智能信息处理研究室）；

1个科技部国家生化中心（深圳国家生化工程技术开发中心）；

7个深圳市重点实验室（深圳市激光工程重点实验室、深圳市特种功能材料重点实验室、深圳市现代通信与信息处理重点实验室、深圳市土木工程耐久性重点实验室、深圳市微生物基因工程重点实验室、深圳市生物医学工程重点实验室、深圳市微纳光子信息技术重点实验室）；

1个教育部省属高校人文社科重点研究基地（中国经济特区研究中心）；

2个广东省高校人文社科重点研究基地（当代中国政治研究所、传媒与文化发展研究中心）；

1个深圳市人文社科重点研究基地（深圳现代艺术与设计研究中心）。