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学费实行学分制收费，先预收；按云发改收费〔2008〕1322号文件收取住宿费。

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本科学费预收费标准：临床医学、口腔医学、麻醉学、医学影像学、预防医学、法医学、医学检验技术、医学影像技术、护理学、药学、康复治疗学、药物制剂、临床药学、卫生检验与检疫、食品卫生与营养学、医学实验技术、听力与言语康复学、眼视光学、儿科学、精神医学、康复作业治疗、康复物理治疗、助产学、眼视光医学等专业收费标准为5000元/年/生；应用心理学、假肢矫形工程专业收费标准为4500元/年/生；法学、劳动与社会保障、公共事业管理、市场营销、信息管理与信息系统、社会工作等专业收费标准为4000元/年/生；运动康复3400元/年/生（实际收费按云南省物价局当年核定标准执行。）

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住宿费标准：分别为六人间800元/年/生和四人间1200元/年/生。如上级部门对本年度学费、住宿费标准进行调整，以上级部门规定的新标准为准。

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少数民族预科班（本科）收费标准为1400元/年/生（实际收费按云南省物价局当年核定标准执行），由云南省少数民族预科教育基地（云南民族大学）收费。