学员按教学计划规定修完全部课程，德、智、军、体等方面考核合格者，准予毕业，符合《中华人民共和国学位条例》规定的学员，授予相应学位。毕业当年6月份，办理入伍提干手续（临床医学专业八年制学员于第五学年结束时办理入伍提干手续），确定为军官或文职干部，并享受中国人民解放军薪金（工资）待遇，家属享受军属待遇。

学员毕业时，统一分配到全军范围医疗岗位。毕业当年可报考硕士研究生，特别优秀的可免试推荐就读硕士研究生。