杭州电子科技大学通信与信息安全实验中心由“通信原理实验室”、“通信系统实验室”、“数字信号处理实验室”、“通信网络实验室”、“信息对抗实验室”、“多媒体通信技术实验室”、“光纤通信网实验室”、“信息安全实验室”, “无线通信与移动通信实验室”、“ 语音图像编码与传输实验室”等10个实验室组成。
1989年建立通信原理实验室；1990年建立现代电视原理实验室,后改名为多媒体通信技术实验室；1998年先后成立“通信系统实验室”“数字信号处理实验室”、“通信网络实验室”；2003年,随着学校整体搬迁到新的下沙校区,已有的5个实验室都进行了不同程度的改建与扩建,改善了实验环境,更新了大量的仪器设备；同时新建信息对抗技术实验室；2004年新建光纤通信网实验室；2005年新建信息安全实验室；2007年新建无线通信与移动通信实验室；2008年光纤通信网实验室获省财政资助，进行扩建，同年还对“通信原理实验室”和“数字信号处理实验室”进行设备更新。2009年获省财政专项资助，新建语音图像编码与传输实验室，同年信息安全实验室也获得省财政资助，进行了改扩建工作。
实验中心采用校、院二级管理，主任负责制，各实验室配有专门的管理责任人，采用中心直管和教研室托管两种方式。
