部级重点实验室：

医学光电科学与技术教育部重点实验室

湿润亚热带生态——地理过程省部共建教育部重点实验室

农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室

部级工程研究中心：

教育部工业微生物教育部工程研究中心

省级重点实验室：

福建省亚热带资源与环境重点实验室

福建省光子技术重点实验室

福建省高分子材料重点实验室

省级工程研究中心：

福建省现代发酵技术工程研究中心

省级行业开发基地：

福建省改性塑料技术开发基地

教育部人文社会科学重点研究基地：

福建师范大学闽台区域研究中心

国经济综合竞争力研究中心福建师范大学分中心
?