黑龙江中医药大学图书馆坐落于“丁香之城”——哈尔滨市，新馆于2011年11月29日正式运行。图书馆始终以“读者至上，服务育人”为工作宗旨，坚持“资源立馆、人才兴馆、服务强馆”的发展方针，现已形成集“藏、借、阅、查、咨、习多功能、一体化、大开放、大流通”的服务模式。
图书馆位于学校综合楼的1—8层及地下二层，馆舍面积达21000余平方米，设有阅览座位3000余个（包括选座系统可选座位1184个），藏阅一体化阅览室10个，大型研修室2个，平台研修区4个，电子阅览室1个。已启用图书自助借还机、微信选座系统、电子书刊阅读机、电子白板等现代化设备。为传承中医药文化，推动校园文化建设，特开设“岐黄特藏文库”、“杏苑墨香书吧”、“经典诵读空间”、“杏林博雅书斋”及“读书漂流驿站”等五个特色空间，除法定假日外，每周开放92.5小时。
图书馆现有各类纸质资源148万册，数据库50个，基本实现了“保证中医药学科，兼顾医学相关门类，关注学校新增专业，满足医、理、文、工、管多学科发展需求”的资源建设目标。古籍阅览室收藏有《四部经典》、《婴童百问》、《妇人大全良方》、《备急千金要方》等珍贵古籍，其中（唐）王冰注（宋）林亿等校（宋）宋兆改误《重广补注黄帝内经》二十四卷本被收入《国家珍贵古籍名录》（二级古籍乙等）。
图书馆设有办公室、采编部、流通部、读者服务部、阅览部、技术部（数图建设部）、检索中心（信息咨询部）、文献检索与利用教研室、特藏室、档案馆等10个部门，可为读者提供外借、阅览、参考咨询、文献检索、科技查新、读者教育、馆际互借、文献传递、阅读推广、特色资源展示、异地馆藏、数字资源使用培训、档案查询等多类型、多层次的服务，最大限度满足教学科研的文献需求。
黑龙江中医药大学图书馆将以“双一流”大学建设为契机，面向教学研究型大学建设，注重内涵发展，增强服务意识、创新服务方式，拓展服务范围，增加服务种类，为建设特色鲜明的国际有一定影响、国内一流的中医药大学做好文献信息保障。
