广东省胃肠疾病重点实验室依托南方医科大学南方医院建设。2009年获批立项。建设期为：2009年—2012年。
研究方向
1.胃肠道肿瘤发生的分子机制与早诊早治研究。
2.肠道粘膜炎性损伤与粘膜屏障研究。
3.幽门螺杆菌（Hp）与胃肠微生态研究。
研究内容
1．胃肠道肿瘤发生的分子机制与早诊早治研究。目标在于发现新的胃肠癌发生、进展标志性分子，并评价其作为药物干预靶点的价值。主要研究胃肠肿瘤与癌前病变发生发展与预后相关分子的调控机制；基于内镜、病理与分子标志的早期胃癌/肠癌筛查方案的建立与评价；胃肠癌预防与早期干预新策略的确定；胃肠癌干细胞耐药机制和逆转。
2．肠道粘膜炎性损伤与粘膜屏障研究。以临床诊治为导向，目的在于发现便宜、简易和高效的诊断技术与治疗药物。主要研究肠道炎性损伤与肠粘膜屏障功能障碍(GBF，肠衰竭)发生与转归的关系和分子机制；肠衰竭的早期发现及其对预防全身性炎症反应与多器官功能衰竭的作用；防治肠衰竭的新药发现、最佳药物组合与疗程确定。
3．幽门螺杆菌（Hp）与胃肠微生态研究。以发现新的生态菌，了解炎症性肠病等原因未明疾病的微生物感染因素为终极目标。主要研究Hp感染致病的免疫病理机制；肠道微生物的宏基因组学研究与新型生态菌的发现；非 Hp 螺杆菌的诊断及其与胃肠疾病的关系；胃肠道特异感染病原的快速诊断。
近期目标
1.在目前经常获得国家省部面上科研项目的基础上，每年获得 1 项以上国家或省部级重大科研课题。
2.在新致病相关螺杆菌的研究方面获得突破，制备检测试剂盒，开展流行病学与临床流行病学调查，推动国内相关研究。
3.在肠（胃）肿瘤研究方面鉴定肿瘤失分化与侵袭相关的重要分子，并评价其作为治疗新靶点的效果。肿瘤干细胞研究方面明确胃肠癌干细胞生存与耐药的关键分子与机制，并探讨药物干预的可行性。
4．肠粘膜屏障与微生态方面，提出以生态制剂为中心防治肠衰竭的综合措施与药物组合，并进行实验与临床验证。
5．成果方面力争每年发表高水平 SCI 论文5 篇以上，三年内获得省部级科技进步二等奖以上奖项目2项以上。
6．人才培养方面，力争培养国家杰出青年1人以上，全国优秀博士论文获得者1人以上，广东省优秀博士学位论文 2 人以上。
