机械工程系是江西应用工程职业学院办学历史最长、规模较大和学院重点建设的系部之一，现开设有制冷与冷藏技术、汽车运用技术、数控技术及应用、模具设计与制造等四个专业。机械工程系重视素质教育，强调能力培养，积极组织学生参加省级技能大赛并多次获奖，学生专业基础知识扎实，综合能力强，就业面宽，毕业生就业供不应求，历年来毕业生就业率达到了97%。
机械工程系现有专、兼职教师30人，其中高级职称有6人，中级职称有15人，双师型教师12人，高级工程师2人，技师和高级技师6人，博士1人，硕士研究生10人。根据人才培养和专业建设的需要，机械工程系系已建立了液压实训室、中央空调实训室、空调冰箱设备维修实训室、热工实训室、模具实验室、模具拆装实训室、汽车拆装实训室、汽车维修实训室、汽车教具实训室、金工实训室、数控机床加工实训室、CAD/CAM实训室、钳工实训室、焊工实训室、铸造实训室等。机械工程系与多家企业建立了校企合作关系。在企业中设有实训基地，并聘请企业工程技术人员专门指导学生进行生产实训。
