福建工程学院坐落于素有“海上丝绸之路”门户之称的历史文化名城福州。学校发端于1896年清末著名乡贤名士陈璧、孙葆瑨、力钧，著名闽绅林纾、末代帝师陈宝琛创办的“苍霞精舍”，首开福州近代新式教育之风。

1907年开始举办工科教育，开设了铁路、电报两科，解放前为享有盛誉的“福建高工”。

1953年后分立为福建机电学校与福建建筑工程专科学校，两校随时代更迭几易其名，曾于1961年分别更名为福建机电学院和福建建筑工程学院，被誉为福建“建筑业的黄埔军校”“机电工程师的摇篮”。

2000年福建高级工业专门学校与福建中华职业大学合并组建福建职业技术学院，

2002年福建建筑高等专科学校与福建职业技术学院合并升格为福建工程学院。

2013年被确定为福建省重点建设高校、硕士学位授权单位。

2017年被确定为福建省博士学位授予培育单位立项建设高校和福建省一流学科建设高校。