黑龙江中医药大学中药学实验室于2000年经省教育厅正式批准为省高校重点实验室，经过近年的建设，实验室现已经形成了一支学历、职称与学缘结构都较为合理的研究队伍和三个稳定发展的研究方向，并且在科研和人才培养等方面都取得了令人可喜的成绩，极大的促进了中药学学科的发展，更促进了黑龙江省医药经济的发展和“北药”开发工作的顺利进行。
现有三个研究方向：中药及复方药效物质基础研究、中药及复方质量评价研究、中药生物活性研究。
中药学重点实验室实行开放、竞争、流动、联合的运行管理机制，走校企合作之路。实验室主任为马英丽教授，学术委员会主任为匡海学教授。目前实验室拥有专兼职人员共32人，其中教授11名、副教授3名、讲师1名、助教6名、高级实验师2名、实验师4名、高级工程师2名，主任药师2名、高级工人1名。
中药学重点实验室现拥有分属于三个研究方向的实验室13个，总面积达1140平方米。
实验室现有实验设备和仪器总价值约为240万元，其中包括学校实验中心的共有设备如共聚焦显微镜、气-质联用色谱仪、毛细管分析系统、红外光谱仪等，另外实验室还自行拥有高效液相色谱仪、气相色谱仪、薄层扫描仪、紫外分光光度计、大型旋转蒸发仪等先进的仪器设备。
2002-2005年共承担各级纵向科研项目36项、横向课题4项，其中省部级以上项目24项（含863项目2项、国家自然科学基金2项、国家科技部攻关项目3项）。目前实验室现可支配项目经费为679万元（纵向334万元，横向345万元）。
近三年来中药学实验室共鉴定教学、科研成果23项，荣获各级科研奖励20项和教学科研奖励3项，科研奖励包括国家级奖励2项（包括国家科技进步二等奖1项）、省（部）级奖励8项（含正在公示的2005年两项省政府科技进步奖）、厅局级奖励10项，并获得发明专利一项。
2002年-2005年共培养硕士研究生35名、博士研究生10名，目前在读硕士研究生38人，博士研究生19人，并有在站博士后6人。
