机电工程系是六安职业技术学院重点建设的教学系之一。现有机械类、电气类和汽车运用三大专业群，设有机电一体化、数控技术、计算机辅助设计与制造、模具设计与制造、电气自动化、供用电技术和汽车运用技术七个专业，2008-2009学年在校学生2047人。 2009-2010学年在校学生2171人。
机电工程系积极探索具有高职特色的“二坚持，三适应，二双制”的人才培养模式。即坚持以服务为宗旨，以就业为导向，坚持以技术应用能力为主线；专业设置与社会需求相适应，培养目标与用人标准相适应，技能训练与岗位要求相适应；双教学大纲（理论和实践），双证书（学生获得毕业证书和职业资格或技能等级证书），努力培养生产、服务、管理一线需要的高级技能性应用人才。
机电工程系重视教师队伍建设。全系现有教职工61人，（其中专职教师59人、兼职教师2人、校外兼职教师8人、校外兼课教师15人），副教授、高级工程师等高级职称教师12人，讲师、工程师等中级职称教师9人；硕士研究生及在读研究生12人；技师和高级技师5人；“双师型”教师26人。为了进一步提高办学水平，充分利用社会力量，机电工程系聘请了三位客座教授。近年来院、机电工程系利用寒暑假，连续选派专业教师赴高校、企业进行业务水平和实践操作技能的培训，为培养合格人才提供师资保障。
学院重视机电工程系的建设，建立了与专业教学相配套的实验实训室。本系拥有电子拖动、维修电工、电子工艺、汽车示教、发动机拆装、模具陈列、普通车床、钳工、焊接、制图测绘、计算机仿真、PLC、数控编程与仿真、公差测量、液压与传动、CAD/CAM、数电模电等17个实验（训）室和数控加工实训、计算机两个中心，教学条件能满足各专业人才培养的要求，保证各专业人才的培养规格。
机电工程系重视毕业生就业工作。根据经济社会对专业人才的需求，广泛开展专业论证和市场调查，瞄准生产、管理、服务的一线，以提高教育教学质量为核心，坚持“以人为本、依法治校、质量为先、特色竞争、和谐发展”的办学理念，专门开设了学生素质和就业指导课，努力提高毕业生的就业率和就业质量。2006年全系毕业生的平均就业率为99.13%，2007年毕业生的平均就业率99%，2008年毕业生的平均就业率100%。2009年的统计就业率为100%，位居全省高校就业率前列。
机电工程系将秉承“自强不息、志存高远、勇于奉献、团结奋进”的校园精神 ，努力“培养既具备一定科学人文素质，又掌握一定专业技术技能，具有良好职业道德和敬业精神的高素质技能型专门人才；使学生学会做人、学会做事、学会生存、学会学习，夯实学生成才的基础” 。为在“十一五”期间创建“省级示范高等职业学校”的总目标而努力奋斗！
