水产科学与技术实验教学中心依托广东海洋大学水产学科建设和运行。水产学科经过70多年的发展，综合实力不断增强，2009年水产学一级学科被列为新增博士学位规划建设授权学科。水产养殖是广东省重点学科，水产养殖学专业为国家高等学校特色专业建设点和广东省名牌专业。广东海洋大学水产学科可用于实验教学的平台有广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室、农业部南方对虾质量安全控制实验室、农业部南美白对虾遗传育种中心、水产经济动物病害控制广东省普通高校重点实验室、南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室、广东省普通高校海产经济无脊椎动物健康养殖工程研究中心以及广东海洋大学海洋生物研究基地、南海渔业资源评估与监测中心、水生生物博物馆等。
水产科学与技术实验教学中心的发展经历了2个阶段：
第一阶段：1962～1997年，为实验教学中心漫长的奠基时期。实验教学中心的前身为始建于1962年的广东水产专科学校生物实验室和海洋渔业实验室，1979年学校升格为本科院校后，生物实验室和海洋渔业实验室为系级管理实验室，1995年被评为广东省高校合格实验室。1991年以生物实验室和海洋渔业实验室长期采集收藏的鱼、虾、贝、藻及其它水生生物标本为基础创建了水生生物博物馆。这一时期，实验室主要负责实验仪器的采购、管理和维护，实验实践教学活动以各专业专任教师组织实施，形成了以专业技能培养为主的实践教学体系，实验室建设为课程建设提供了有力的支撑。《海产经济动物增养殖学》、《鱼病学》、《淡水经济动物增养殖学》分别于1994、1995、1997年被评为省级重点课程，专任教师主编出版了《生物饵料培养》、《贝类学概论》、《海藻学概论》、《养殖土木工程》等一批实践性较强的高水平教材，“海产经济动物增养殖学课程建设与改革”获1997年广东省教学成果二等奖。
第二阶段：1998年至今，为实验教学中心的构建与发展时期。1997年原湛江水产学院与湛江农业专科学校合并为湛江海洋大学后，1998年原有实验室整体搬迁至湖光岩校区。以此为契机，对原有实验室进行了初步功能整合，组建成综合型实验室，成为院级管理实验室。2006年，为深化实验教学和实验室管理体制改革，经学校批准，成立了水产科学与技术实验教学中心，下设水产基础生物学实验室、渔业资源与环境实验室、生物技术实验室、水产动物病害与防治实验室，实行校、院两级管理。这一时期，中心添置了微机生理实验教学系统、数字网络显微互动实验教学系统等一系列先进的教学仪器设备，使实验教学设备更加完善，取得更好的实验效果。在实验室硬件建设的同时，中心组织开展了教学研究与改革，着重在课程体系的优化、课程建设与改造、实践教学体系构建、校场联合培养人才模式等方面进行研究与实践，取得可喜的成果。先后承担的广东省教学改革研究项目“水产养殖本科人才培养方案及教学内容和课程体系改革的研究与实践”和“水产养殖本科实验实习教学创新体系的建立和实践”分别获广东省2001年教学成果一等奖和广东省2005年教学成果二等奖。2004年，水产养殖学专业被评为广东省名牌专业，2008年获批国家高等学校第一类特色专业建设点。
目前，中心拥有实验用房使用面积2009m2，单价在800元以上的仪器设备1167件套，总值为633万元，拥有生物标本3000多种，为本科生、研究生培养提供了良好的条件。中心建立了结构合理的实验教师队伍，拥有实验技术人员和实验教师47名，兼职教师21名，专兼职教师和实验技术人员中有正高级职称17名，副高级职称17名，具有博士学位教师27名，享受国务院政府特殊津贴专家2人；广东省高等学校“千百十工程”培养对象6人。国家模范教师、优秀教师各1人，广东省教学名师3人，省级优秀教师5人。
近5年来，中心教师主持承担课题272项，到账科研经费5257万元，其中主持与承担国家自然科学基金9项、国家973计划1项、国家863计划3项、国家科技支撑计划8项、科技部农转资金2项。发表论文447篇，其中SCI、EI收录31篇。获市级以上科学技术奖励16项，其中“华南地区对虾产业高效技术”获广东省科学技术奖一等奖。获授权专利7项，其中发明专利4项。出版著作8部，主编、参编教材11部。
2010年，以建立实验教学新体系和理顺实验室管理体制为突破口，根据水产学院现有资源和人才培养要求，将南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室、水产经济动物病害控制广东普通高校重点实验室、海洋生物工程实验室（中央与地方共建特色优势学科实验室）、南海海洋渔业资源评估与监测中心、东海岛海洋生物研究基地（实习基地）等整合到实验教学中心的，构建水产基础生物学、水产增养殖技术、渔业资源与环境、综合与创新技能4个实验分室，下设11类功能实验室，打破原有的二级学科界限，建立了集中统一管理的中心管理体制。
经过多年的建设与发展，中心已成为实验室管理规范、实验设施完善、队伍结构合理、教学效果显著，成果突出的水产科学与技术实验教学中心，为社会培养了一大批高水平的水产科技人才。
