贵州省高性能计算化学重点实验室始建于1999年，2000年6月通过省科技厅组织的建设阶段验收，正式挂牌成立，2003年10月通过省科技厅组织专家组的评估考核。
贵州省高性能计算化学重点实验室是在省科技厅的领导和关怀下，省科技厅投入40万元资金，在贵州大学计算化学实验室的基础上建立起来的，通过网络面向全国开放的重点实验室。同时也是贵州大学物理化学和无机化学两个硕士学位授予点以及中国科学院地球化学研究所矿物物理博士学位授予点的教学基地。实验室的建设还得到“贵州省跨世纪人才工程”项目、贵州省省长专项基金、国家自然科学基金重大项目、国家自然科学基金的大力支持。
贵州省高性能计算化学重点实验室的主要研究方向是从量子力学基本原理出发、通过大规模高性能并行计算，实现对分子、原子簇、超分子体系结构与能量性质的精确模拟、研究非键相互作用本质、生物大分子结构与功能、药物分子设计、材料电子结构问题中的挑战性问题。
贵州大学高性能计算化学实验室GHPCC是在“贵州省跨世纪人才工程”项目、贵州省省长专项基金、国家自然科学基金重大项目、国家自然科学基金和贵州科技厅自然科学基金相关课题经费资助下，建立的专门从事大规模量子化学计算的实验室。
GHPCC不仅是本实验室研究人员从事量子化学、分子、原子簇结构与能量计算、生物与药物分子设计、分子模拟的研究基地，同时也是贵州大学物理化学、无机化学等硕士学位点的教学基地以及中科院多个研究所的联合教学基地。
GHPCC采用集群技术构建了三套64位多核并行计算系统，通过千兆以太网连接，总运算能力的理论峰值超过10000亿次浮点运算。
GHPCC同时还引进了GAMESS-US, NWCHEM, Dalton, Dirac, Columbus, MPQC, ADF, Gaussian, MOPAC2009 等大型通用量子化学软件和Tripos SYBYL药物分子设计软件。
GHPCC 的学术带头人是博士生导师 王一波 教授，GHPCC Web站点的制作、维护由 何禹 负责。
“十五”以来承担的课题情况:
（1）参与国家自然科学基金“九五”重大项目：有序高级结构分子聚集体的结构、构筑与性能研究。编号：29992590-1，第一子课题总经费52万，本实验室15万，起止时间：1999年至2004年。
（2）主持国家自然科学基金项目：富勒烯与金属卟啉超分子相互作用本质研究。编号: 20463002，总经费20万元，起止时间：2004年至2007年。
（3）主持国家自然科学基金项目：分子间相互作用的密度泛函理论新方法研究。编号：29763001，总经费10万元，起止时间：1998年至2000年（已批准结题）。
（4）主持贵州省长专项基金项目：大分子间相互作用量子化学计算方法研究。批文号：黔科教办（2001）3号。总经费25万元，起止时间：2001年至2003年。
（5）主持贵州省跨世纪人才专项基金项目：量子化学计算方法及其应用研究。总经费66万元，起止时间：1998年至2003年。
（6）主持贵州省科技厅贵州省高性能计算化学重点实验室建设项目。总经费40万元，起止时间：2000年至2003年。
（7）主持贵州省科学技术基金项目：Web远程可视化Cluster计算化学系统研制。编号：黔基合计字(2003)3007, 总经费2万元，起止时间：2003年至2005年。
（8）主持贵州省科学技术基金项目：氨基酸与水相互作用势的理论研究。编号：黔基合计字(2000)3057, 总经费2万元，起止时间：2000年至2002年。
（9）主持贵州省科技计划课题：PC Linux群集量子化学从头计算性能研究。编号：黔科合字(2003)JN030, 总经费2万元，起止时间：2003年至2005年。
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