麻醉学基础理论与应用研究实验室于2001年5月，被省教育厅批准成为黑龙江省高校重点实验室。经过不断的建设，于2006年以优秀的成绩通过省高校重点实验室的验收。
实验室有稳定的研究方向，在麻醉学的基础理论与应用方面的研究得到了提高，尤其在围术期器官功能保护方面研究取得显著成效，培养了博士研究生18人，硕士研究生72人。获得不同层次课题 55 项，其中国家自然科学基金6项，获得教育部科技进步二等奖1项、中国高校科技进步二等奖1项、省政府科技进步二等奖1项、三等奖3项，发表科技论文140篇，发明国家新型专利2项。
实验室建立了麻醉学相关的研究平台，增添了许多大型的设备，如流式细胞仪、气质联用仪、高效气相色谱仪、液相色谱仪、凝胶成像仪、荧光显微镜、膜片钳、16导多功能生理监测仪、PCR仪等，满足了麻醉学基础理论与应用研究所需条件，并为继续深化或拓宽领域的研究奠定了基础。本实验室已成为国内麻醉学界一流的实验室，日本麻醉学专家小林 勉教授曾在此实验室工作。
