园艺系是北京农业职业学院主干系部之一，现有教职工48名，在校生29个班，1056人，其中高职生18个班， 655人，中职生11个班， 401人。园艺系始终坚持面向市场、面向应用、面向就业的教育方针，开展多形式办学，在全系教职工的共同努力下，走出了一条在适应社会需求中改革、在改革中求发展、在发展中稳步提高的教改之路，办学水平、规模和效益不断提高。
园艺系以传统专业优势为基础，以市场人才需求为导向进行专业设置，现有园林、园艺、食品工程技术、绿色食品生产与检验等4个大专层次的高职专业，园林、园艺、农产品保鲜与加工、绿色食品生产与开发等4个中职专业，2004年起园艺专业开始招收初中后5年制高职专业。园艺专业是农业部能力体系建设试点专业，园艺专业、园林专业、绿色食品生产与检验专业是北京市和学院重点建设专业。园艺专业实训基地是国家级示范基地，园艺专业、绿检专业是北京市示范基地。
园艺系有一支教学经验丰富、实践能力强的双师型教师团队，现有专职教师37名，其中博士5名，硕士16名，在读研究生9名，双师型教师占85％。园艺系教师团队是院办园林绿化三级资质企业的主要技术支撑，有过半数的教师受聘于北京地区多家企、事业单位，担任专家、技术顾问等职务，有19名、21人次教师在北京郊区进行镇长助理挂职；有北京市教学名师1名、市级优秀青年骨干教师2名；被市教委命名为北京市园艺技术创新团队；承担了北京市园艺园林专业师资培训项目。
园艺系近3年来，开展了农村、企业现场指导、讲座、培训、咨询以及教师乡镇挂职、“住村”等多种形式的为为企业、为农民服务活动，服务企业60多个，农村服务范围覆盖全市13个郊区县的51个乡镇、123个行政村，培训22765人次，带动了农民增收致富，被农民誉为“实用技术的好专家、农民致富的好帮手”。
学院成立五年来，园艺系教师在教科研方面取得了丰硕成果。共承担教学科研项目15项，其中包括国家级精品课程建设《果蔬贮运与加工》、等国家级课题5项，“农业棋牌网页游戏平台 实训体系的构建与创新研究” “梨果实套袋及大面积推广”和市级精品课程《果树生产技术》建设等8项为省部级项目。
园艺系主编国家《果蔬贮运与加工》等“十一五规划” 教材四部，主编《果树生产技术》等高职高专教材10本，参编《花卉生产技术》等18本高职高专教材；主编和参编各类培训教材和丛书68本，主编达到50人次，教师参与率达到90%；发表SCI论文4篇、EI论文1篇，在各类核心期刊发表论文48篇；获市级科技进步一等奖3项；二等奖3项，三等奖2项；教学成果奖10项。
园艺系拥有功能齐全、内涵丰富的实验、实训基地，现有植物、树木、植保等标本室，植物生理、显微镜、园艺植物栽培、插花艺术、植物保护、园艺机械、组织培养、食用菌、农产品加工、农产品检验等13个实训室；有300亩的果树、花卉、蔬菜、苗木、药材等露地实训基地；有20栋日光温室、5000㎡的智能温室、食品加工实训和安全食品检验实训车间。能够满足学生教学、实验、实训需求，承担学生和校外相关行业人员的职业技能鉴定任务，承担产学研合作的科研课题的试验研究。
同时，为全面培养学生的综合实践能力，园艺系还与中日友好观光果园、锦绣大地农业股份有限公司、小汤山特菜基地、顺义三高科技农业试验示范区等20多家从事园艺生产、园林绿化施工、食品标准化生产与食品安全检测的企业建立了长期合作关系，并签订了学生实习协议。校企双方建立了“企业为主、学校参与、共建双赢”的管理运行机制；共同成立了基地运行管理小组，制定了严格的顶岗实习管理制度，加强顶岗实习管理，注重对学生应职岗位综合能力的培养，实现了毕业生从学校到社会的平稳过渡。
