我校自2010起，实行研究生培养机制改革，录取的研究生均按照改革后研究生奖助体系享受基本奖助金。基本奖助金的标准将明显高于改革前助学金标准，基本奖助金标准分为三档：一等800元/月，二等600元/月，三等400元/月,每学年评定一次。入学第一年按照第一志愿录取新生享受二等600元/月、调剂录取新生享受三等400元/月的标准。
一、招生人数：2012年我校拟定招收硕士研究生905人，其中专业学位235人，具体招生规模数，以国家下达计划为准，根据教育部实际下达计划数、生源状况和学校发展需要，对学校招生总规模数及各专业招生数进行适当调整。
二、考试科目：
1.由教育部考试中心命题的科目有：101思想政治理论、201英语一、204英语二、301数学一、302数学二、303数学三、314数学（农）或315化学（农）、414植物生理学与生物化学、415动物生理学与生物化学、408计算机学科专业基础综合。
2.由水产学科基础综合联考工作小组命题的考试科目有：416普通动物学与普通生态学、417普通生态学与鱼类学。
3.由我校自行命题有：340农业知识综合二，341农业知识综合三，342农业知识综合四，601高等数学，以7××、8××、9××代码开头的考试科目。
各硕士点复试均要安排专业课的笔试，笔试科目见我校网站研究生招生目录中的说明。为帮助考生考前复习，我校已编写部分专业课及复试考试课程的考试大纲，考生可到我校网站下载考纲等材料。
三、说明：专业代码6位数最后两位数为零的专业，均为按一级学科招生。打★的专业为我校自主设置二级学科。各招生专业在复试时，双向选择确定导师。
四、联合培养情况：我校与中国水产科学研究院（简称：中国水科院）、上海农业科学院（简称：上海农科院）、上海光明集团等多家单位联合培养研究生，培养方式为：基础课程在上海海洋大学完成，学位论文工作在各联合培养单位进行，按照上海海洋大学统一要求进行论文评阅和论文答辩，并由上海海洋大学颁发毕业证书和学位证书。
中国水科院、上海农科院的招生目录已单列。报考这两个单位的考生，网上报名时必须直接选择这两个单位。在这两个单位的招生专业中，一级学科“生物学”、“海洋科学”专业均按照我校生命科学学院相同专业及研究生方向进行培养，一级学“科环境科学与工程”专业均按照海洋学院相同专业进行培养。
