哈萨克文化研究所
教育科学研究所
中亚研究所
应用数学研究所
凝聚态物理与材料设计研究所（与南京大学共建）
资源与生态研究所（与中国科学院新疆分院共建）
园林科学研究所
阿依特斯艺术研究中心
伊犁学研究中心
