农业部动物生理生化重点开放实验室是以我国第一个家畜生理研究室（由农业部批准于1981年成立的南京农业大学家畜生理研究室）和全国第二批博士点（1986年）授予单位为基础，联合校内相关学科（动物营养、繁育及食品研究的应用基础部分），于1990年组建而成。实验室所在兽医学学科1992、1994分别被评为农业部和江苏省重点学科，在2000年的评比中被确认为“A”级学科，2007年又被评为国家重点学科。1986年起实验室多次被评为全国和省级先进实验室，2012年第五次被评为农业部动物生理生化重点实验室。
实验室现有固定人员30人，其中教授15名、副教授7名，讲师5名，技术员3名，,90%以上有国外学术背景。专业包括生理学、生物化学、分子生物学、细胞和组织化学、育种学、营养学和免疫学等，充分反映学科交叉和合作。实验室总面积为2000平方米,设有分子生物学、遗传学、内分泌及神经内分泌、细胞生物学、组织化学和生物化学等专门实验室。另外，本实验室还拥有500平方米的实验动物房，并与多个大型猪场、鸡场、鸭场等生产单位建立了良好的科研合作关系。
2006-2011年期间，承担科研项目212项，其中“973”计划子项目2项、国家科技重大专项3项、公益性行业科研专项1项、国家自然科学基金37项、“948”项目2项、“863”项目子任务1项、国际合作项目32项、部省级研究项目78项,总经费达7518万元。
本实验室获得国家科技进步二等奖1项，部（省）级一等奖4项，二等奖11项，三等奖17项，其他奖励12项。2006-2011年期间，实验室在国内外核心期刊上共发表研究论文653篇，其中中文核心期刊论文458篇，SCI收录论文195篇；出版《家畜生理学》、《动物生物化学》等专著和教材35部。申请国家发明专利22项，其中已授权9项，制定饲料添加剂“半胱胺盐酸盐β环糊精微粒”，“4′,7-二羟基异黄酮”等国家标准2项、国家检测标准1项、地方标准6项。
