国家工程中心：

感染性疾病分子生物学省部共建教育部重点实验室

超声医学国家工程研究中心

教育部重点实验室：

感染性疾病分子生物学教育部重点实验室

市教委工程中心：

重庆高校药物工程研究中心

省部共建实验室：

重庆市超声医学工程重点实验室－省部共建国家重点实验室培育基地

临床检验诊断学省部共建教育部重点实验室

市科委重点实验室：

超声医学工程重庆市市级重点实验室

临床检验诊断学重庆市市级重点实验室

感染病研究重庆市市级重点实验室

市教委重点实验室：

重庆市感染性疾病分子生物学实验室

重庆市儿科学实验室

重庆市生物医学工程实验室

重庆市临床检验诊断学实验室

重庆市生物化学与分子药理学实验室

重庆市神经病学实验室

市卫生局重点实验室：

重庆市传染病寄生虫病学重点实验室

重庆市神经病学重点实验室

重庆市普外科学重点实验室

重庆市肝胆外科重点实验室

重庆市妇产科重点实验室

重庆市儿科重点实验室