中药有效成分重点实验室于2006年由教育部批准立项建设，中药重点实验室预期在二年内对十种以上长白山地道药材进行化学成分和有效成分以及构效关系的研究，发表研究论文20篇以上；提高和建立已有药品、药材标准十种以上；研发新药两种以上。上述的研究工作要达到国内先进或领先水平，部分基础研究工作要达到世界先进水平。
研究方向：
1、长白山药用资源有效成分物质基础研究
2、动植物药生物大、小分子构效关系研究
3、中药材、中药饮片、提取物、中成药质量标准研究
4、中药有效成分的生物制品工程化与新药开发研究
人员组成：
实验室学科队伍现有人员53人。其中博士生导师5名、硕士生导师18名；教授15人、副教授10人、讲师8人、助教6人；实验系列人员10人，管理人员4人。具有博士20名、硕士15名。45岁以下的中青年人员大于50％，其中具有硕士以上学位的人员大于70％，中级以上专业技术职务且年龄在40岁以下的人员大于15％。
研究内容：
应用现代技术对中药有效成分进行分离纯化、结构鉴定。结合药效学研究，进行中药成分活性与结构的构效关系研究；对中药大分子成分活性与结构的关系进行深入的研究，开发药用机理、疗效确切的多糖和多肽药物；提高现有药品的标准，提高药品的可控性和有效性，采用化学指纹图谱方法研究中药材、中药饮片、提取物和中成药的质量标准；通过研究临床疗效确切的中药大品种和本校附属医院院内制剂的有效成份或有效组群结构和疗效关系，进而达到提升药品标准、开发新药的目的。
承担项目：
1、苦碟子治疗脑血管性痴呆活性物质的筛选及药代特性和安全性早期评价，国家新药创制重大专项
2、抗肿瘤候选新药---小飞蓬活性抗癌胶囊的研究 国家重大新药创制专项
3、治疗冠心病心绞痛中药新药三苦滴丸的临床前研究，国家新药创制重大专项
4、治疗痛风病中药五类新药玉米须总黄酮开发研究，国家新药创制重大专项
5、国家科技重大专项课题“敖东中药中试放大研究技术平台”， 国家新药创制重大专项
6、长白山特种药材技术标准及关键技术研究与开发----小飞蓬等长白山常用中药材活性组分及应用研究，国家科技支撑项目
7、长白山特种药材技术标准及关键技术研究与开发，国家科技支撑计划
8、林下参资源普查，国家科技部十一五支撑项目
9、人参、梅花鹿产业化开发关键技术研究，国家科技部。
10、四种北药不同采收期质量变化的研究，国家中医药管理局。
11、苦碟子注射液指纹图谱的研究，国家科技部、药典委员会。
12、三黄前必治软胶囊的研制，国家科技部十一五支撑项目
13、辽藁本资源调查，国家环保总局课题
14、中药引经作用的途径及其体内外作用的物质基础研究，国家中医药管理局课题
15、纳米参红富力软胶囊的研究与开发，吉林省科技厅
16、蜂胶总黄酮研究，吉林省科技厅重大项目
17、哈蟆油中止咳活性成分1-甲基海因的应用开发研究，吉林省科学技术厅重点项目
18、长白山道地动物药材质量标准研究，吉林省中医药管理局
19、长白山真菌药材治疗慢性萎缩性胃炎有效成分的研究，吉林省科技厅
20、5-羧基瑞香素新药开发—制备工艺、质量标准、药效学，作用机理的研究，吉林省科技厅
21、吉林民间药珍珠透骨草黄酮类成分抗炎作用，吉林省教育厅
22、类脂质体制备技术在银杏叶提取物中的应用，吉林省科学技术厅
23、银杏叶提取物非离子表面活性剂泡囊的制备工艺研究，吉林省教育厅
24、马钱子总生物碱治疗EAN家兔th亚群作用机制的研究，吉林省教育厅
获奖情况：
1、高其品，七种药材和饮片标准化规范化的研究，省科技进步三等奖， 2007，第一名
2、张辉，一种质量乳腺增生的中药新药，吉林省中医药管理局科技进步二等奖，2007，第一名
3、张辉，一种质量乳腺增生的中药新药，中华中医药学会科技进步三等奖，2008年
4、 高其品，返魂草等十四味道地药材的地方质量标准的研究，长春市科技进步一等奖，第二名，2009年
5、邱智东，小叶石韦治疗肾病活性组分筛选的研究，吉林省科技厅成果，2008年
6、赵雨，吉林省道地药材人参、刺五加、淫羊藿及黄芪优质提取物生产及质量标准研究，吉林省科学技术成果
7、赵雨，长白山道地药材有效部位提取、分离工程化研究，吉林省科学技术成果，2009年
仪器设备：
根据现有的装备情况，在建设期间新增设备总值800万元，包括购置UPLC 、HPLC 、GC 、红外光谱仪、自动生化分析仪、二维电泳仪、毛细管电泳仪、自动熔点测定仪、低温层析系统等。本实验室的装备水平可达到国内先进水平。
