建筑工程系成立于2004年4月,溯源自1958年成立的福建地质学校（1995年更名福建工程学校）,至今已有六十余年办学历史。近年来，坚持“厚德强能”教育教学理念，以“善建勤工”为系训，传承地质精神，不断探索人才培养的新模式、新路径，探索校企合作办学的新机制，整体办学水平和社会影响力不断提升，建设特色鲜明的建工专业群不断取得进展，建设中的测绘地理信息专业群也渐显成效。近三年来，我系学生在国家级、省级各类职业技能竞赛中屡创佳绩，共获国家级一等奖1个、二等奖7个、三等奖2人，获省级一等奖4个、二等奖8个、三等奖4人。在2017年全国职业院校信息化教学大赛中，我系教师荣获高职组信息化教学设计比赛一等奖，实现我省在该赛项上零的突破。
建筑工程系现开设建筑工程技术、工程造价、建筑装饰工程技术、地籍测绘与土地管理与摄影测量与遥感技术（无人机方向）等5个专业，其中建筑工程技术是国家骨干院校重点建设专业，摄影测量与遥感技术（无人机方向）为2019年新增专业。同时，对接信息技术在建工、测绘地理信息领域的应用，规划在2020年申办建设项目信息化管理（BIM）、导航与位置服务专业。目前在校生1285人。
校内现拥有实验实训场地面达 5000多平方米，设备总价值1230多万元。校内实训基地引入企业工作环境，建有18个省内领先的专业实训室，13个学生专业实践工作室，2019年新建1：1等比例建筑模型楼及建筑信息化BIM理实一体实训室，提供虚实一体的信息化教学实训中心，为学生提供了良好的成才环境。同时，与福建地矿建设集团、厦门中诚建建筑劳务有限公司、泉州联审工程造价咨询有限公司、福建省晨曦信息科技股份有限公司、福建地质测绘院、福建省硕威工程科技股份有限公司、福州市勘测设计院等50多家企业共建校外实训基地。
建筑工程系现有教职工52人，其中专业教师41人，副高职称20人，具有硕士学位的教职工27人,绝大部分教师有企业实践工作经历,具备“双师”素质。同时拥有特聘教授1人，并另聘请了50余名具有丰富理论基础和实践经验的专家、高级工程师为客座教授、兼职教师。
建筑工程系注重学生学历与能力提升，集美大学在学校设立专本衔接教学点，面向我系在校生招收工程管理专业专本衔接学生。在校期间，学生同步进行本科课程学习，专本衔接课程全部考试合格且获得专科毕业证书，半年后可申请集美大学颁发的大学本科毕业证书。学生还可在通过学位英语考试后，按照集美大学本科学位管理委员会的规定获得学士学位证书，国家承认其本科学历和学士学位。
建筑工程系坚持以“产教融合”为核心，构建多元协同育人新模式；以“工匠精神”为核心，推动教育教学改革；以“立德树人”为核心，探索校园品牌文化建设，努力为社会培养更多能吃苦、善沟通、懂技术的高素质技术技能人才。
