建筑工程系是重庆工贸职业技术学院的骨干教学系之一，现开设有建筑工程技术专业、工程造价专业、水利水电建筑工程、建筑装饰工程技术、物业管理、道路桥梁工程技术等六个专业。其中建筑工程技术专业是重庆市级示范高职院校重点专业、重庆市骨干建设专业、重庆市教学改革试点专业、学院重点专业、中澳职教合作项目专业，水利水电建筑工程专业是创院级特色专业。2011年1月29日国务院正式颁布“中央一号文件”，首次将水利提升至国家战略高度，未来十年将投资四万亿元大兴水利。各地区紧随中央政策出台地区一号文件，重庆市在“十二五”期间将完成水利投资1000亿元。“中央一号文件”已经向全党全社会发出了大兴水利的明确信号，水利水电建筑工程专业就业前景广阔。全系现有在校普通高职学生1000余人。各专业实行“双证制”，获得职业资格证书的比率均在95%以上，毕业生就业率均在98%以上。
建筑工程系教师年龄结构、职称结构、学历结构和素质结构合理，是一支一专多能、水平较高、充满活力的教学实践团队，具有很强的敬业精神，在各专业领域内均有深入的研究。现有教师35人，其中副教授以上职称8人，双师素质教师20人，硕士研究生8人，具有丰富的教学、管理和实践经验，教风严谨。50%的教师在相关企业从事设计、施工管理、技术服务工作。同时聘请了30名来自行政事业、科研、企业具有丰富理论基础和实践经验的专家、工程师为客座教授。
近年来在各级各类刊物上发表学术论文200余篇，交流获奖论文30余篇，主编、参编教材16部，重庆市和学院科研立项6项、市级精品课程1门，院级精品课9门。
实训基地建设 建筑工程系拥有中央财政支持的国家棋牌网页游戏平台 实训基地，已建成棋牌网页游戏平台 区域性共享实训基地——建筑实训中心，配有建筑工种实训场、智能建筑设备实训室、工程地质实训室、建筑材料实训室、工程质量检测实训室、测绘实训室、结构实训室、地基基础实训室、屋面与防水工程实训室、道桥模拟仿真实训室、土工实训室、资料室、CAD实训室、工程造价实训室、工程项目管理沙盘模拟实训室、装饰构造实训室、装饰材料展示实训室、装饰设计实训室、水利水电枢纽仿真实训室、水力学实训室、制图实训室等21个实训室（场），各类实训设备设施价值1100万元。与重庆和涪陵等地的知名企业合作建立了22个校外实训基地，可以满足学生实训和顶岗实习的需要。学生在校学习的同时可以参加施工员、预算员等高中级职业资格鉴定和建筑工程10个工种的技能鉴定，学生毕业时可以获得双证（毕业证和职业资格证书）就业。
参加第四届广联达全国高校预算软件算量大赛获得个人三等奖，参加第二届广联达全国高校工程项目沙盘比赛获得团体一等奖，参加第五届全国水利高职院校学生技能竞赛获得个人二等奖1人、三等奖8人。2012年参加全国高等职业院校土建施工类专业学生首届 “鲁班杯”建筑工程识图技能竞赛获得团体一等奖，个人一等奖两项， 2013、2014年组织学生参加第六、第七届重庆市高职院校学生职业技能竞赛均获得团体三等奖，2016年组织学生参加第九届重庆市高职院校学生职业技能竞赛“工程测量”项目，获得两个三等奖，2017年组织学生参加第十届重庆市高职院校学生职业技能竞赛“工程测量”项目获得二等奖和三等奖、“建筑识图”项目获得三等奖。同时注重加强学生思想道德建设与学风建设，加强学生职业能力、综合素质培养，加强人文素质教育，开设了各种选修课程和第二课堂，邀请行业专家到学院举办学术讲座，举办各种技能大赛，组织各类文娱体育竞赛，成立了各类社团，开展学生的科技文化活动和社会实践活动等，提高学生的综合素质。建筑工程系毕业生深受社会和用人单位的好评，称之为“下得去、用得上、留得住”，能很快成长为企业的技术与管理骨干。
